La première question après un arrêt maladie arrive souvent avec le bulletin de paie suivant : pourquoi manque-t-il autant d’argent ? Entre les jours de carence, les indemnités journalières plafonnées et un complément de l’employeur qui démarre plus tard, un arrêt d’une semaine peut coûter plusieurs centaines d’euros.
Ce guide traite uniquement de l’argent : qui vous paie, à partir de quel jour, à quel taux, et ce que votre convention collective peut améliorer. Les démarches (envoi sous 48 heures, heures de sortie, contrôles) sont détaillées dans notre article sur l’arrêt de travail et ses obligations.
📌 Ce qu’il faut retenir : la Sécurité sociale verse 50 % de votre salaire journalier de base après 3 jours de carence, dans la limite de 42,97 € bruts par jour au 1er juillet 2026 (ameli.fr, page mise à jour le 1er septembre 2026). Avec un an d’ancienneté, l’employeur complète jusqu’à 90 % du brut, puis deux tiers, mais seulement à partir du 8e jour d’arrêt. Votre convention collective peut réduire ou supprimer ces délais.
Qui vous paie pendant un arrêt maladie ?
Trois étages de revenu peuvent s’additionner. Votre caisse d’assurance maladie verse des indemnités journalières. L’employeur ajoute une indemnité complémentaire prévue par la loi si vous avez au moins un an d’ancienneté (article L1226-1 du Code du travail). Une convention collective, un accord ou un contrat de prévoyance peut enfin améliorer ce complément.
Chaque étage a ses propres conditions, son propre délai de carence et son propre plafond. Un salarié peut toucher le premier sans le deuxième, faute d’ancienneté. Il peut aussi toucher les deux sans rien au-delà si sa branche ne prévoit rien. Et c’est la combinaison des trois qui explique l’écart entre votre salaire habituel et ce qui arrive sur votre compte. Avant tout calcul, identifiez donc votre convention collective et vérifiez si l’entreprise a souscrit une prévoyance.
Le complément légal fixe un minimum que les accords peuvent dépasser.
Combien versent les indemnités journalières ?
La caisse additionne vos salaires bruts des 3 mois précédant l’arrêt et divise le total par 91,25. Ce salaire journalier de base est plafonné à 1,4 fois le SMIC mensuel. L’indemnité vaut 50 % de ce montant, soit au plus 42,97 € bruts par jour au 1er juillet 2026 (ameli.fr, page mise à jour le 1er septembre 2026).
Mais le droit ne s’ouvre qu’à certaines conditions. Pour un arrêt de moins de 6 mois, il faut avoir travaillé au moins 150 heures au cours des 3 mois précédents, ou cotisé sur un salaire au moins égal à 1 015 fois le SMIC horaire sur 6 mois. Les trois premiers jours ne sont pas indemnisés, sauf exceptions comme certaines affections de longue durée. La CSG et la CRDS sont prélevées sur le montant brut. Pour un salaire élevé, le plafond fait tomber l’indemnité bien en dessous de la moitié du salaire réel.
Le simulateur ci-dessous combine ces règles avec le complément légal de l’employeur.
Quels jours de carence restent à votre charge ?
Sans convention plus favorable, les 3 premiers jours ne sont payés par personne. Du 4e au 7e jour, seule la caisse verse ses indemnités. Le complément légal de l’employeur ne démarre qu’au 8e jour d’absence, après un délai de carence de 7 jours (article D1226-3 et service-public.gouv.fr, fiche vérifiée le 1er juin 2026).
Ce décalage frappe surtout les arrêts courts. Un arrêt de cinq jours ne déclenche jamais le complément légal, et deux arrêts courts dans le même mois font jouer la carence deux fois. Pourtant, beaucoup de branches ont réduit ce délai, parfois à zéro. Le premier jour d’absence reste aussi indemnisé par l’employeur si l’arrêt vient d’un accident du travail ou d’une maladie professionnelle, hors accident de trajet. C’est la clause « maladie » de votre convention qui fait la différence, bien plus que la loi.
Le tableau ci-dessous suit un arrêt maladie ordinaire pour un salarié qui a entre 1 et 5 ans d’ancienneté.
| Période de l’arrêt | Sécurité sociale | Employeur (minimum légal) | Revenu brut garanti |
|---|---|---|---|
| Jours 1 à 3 | Rien (carence) | Rien (carence) | Aucun |
| Jours 4 à 7 | IJ de 50 % du salaire de base plafonné | Rien (carence) | IJ seules |
| Jours 8 à 37 | IJ | Complément jusqu’à 90 % du brut | 90 % du brut |
| Jours 38 à 67 | IJ | Complément jusqu’aux deux tiers du brut | Deux tiers du brut |
| À partir du 68e jour | IJ | Plus de complément légal | IJ seules |
Code du travail, art. L1226-1, D1226-1 à D1226-3, en vigueur au 29 septembre 2026. Les durées augmentent avec l’ancienneté, et la convention collective peut prévoir mieux.
Quand l’employeur doit-il maintenir votre salaire ?
Il le doit si vous avez au moins un an d’ancienneté, si vous avez justifié l’arrêt dans les 48 heures, si la Sécurité sociale vous prend en charge et si vous êtes soigné en France ou dans l’Union européenne ou l’Espace économique européen. Le texte exclut les salariés à domicile, saisonniers, intermittents et temporaires (article L1226-1, version en vigueur au 29 septembre 2026).
« Tout salarié ayant une année d’ancienneté dans l’entreprise bénéficie, en cas d’absence au travail justifiée par l’incapacité résultant de maladie ou d’accident constaté par certificat médical et contre-visite s’il y a lieu, d’une indemnité complémentaire à l’allocation journalière prévue à l’article L. 321-1 du code de la sécurité sociale »
Article L1226-1 du Code du travail, version en vigueur au 29/09/2026
Le complément porte votre revenu à 90 % de la rémunération brute que vous auriez perçue pendant 30 jours, puis aux deux tiers pendant 30 jours. Ces durées augmentent de 10 jours par tranche de 5 ans d’ancienneté au-delà de la première année, sans dépasser 90 jours chacune (articles D1226-1 et D1226-2). Or le calcul se fait déduction faite des indemnités journalières et de la part de prévoyance financée par l’employeur (article D1226-5). L’employeur ne verse donc que la différence. Et les arrêts indemnisés au cours des 12 mois précédents s’imputent sur ces durées (article D1226-4). Depuis le 27 juin 2026, le complément est aussi écarté en cas de fraude avérée du salarié pour obtenir les indemnités journalières, dont la caisse a informé l’employeur (article L1226-1 modifié par la loi n° 2026-534 du 25 juin 2026).
Ce complément a une contrepartie : l’employeur peut organiser une contre-visite médicale.
🚫 Idée reçue : « avec un an d’ancienneté, je suis payé à 100 % »
La loi garantit 90 % du brut, puis deux tiers, et seulement à partir du 8e jour. Le maintien intégral du salaire, dès le premier jour, n’existe que si votre convention collective, un accord ou votre contrat le prévoit. Avant de contester une retenue, lisez la clause « maladie » de votre texte conventionnel et comparez-la à votre bulletin de paie.
Comment fonctionne la subrogation ?
Avec la subrogation, l’employeur vous verse votre salaire et perçoit à votre place les indemnités journalières de la caisse. Elle s’applique de plein droit quand le salaire est maintenu en totalité. En cas de maintien partiel versé sans déduire les indemnités, elle joue si le salaire maintenu est au moins égal aux indemnités dues pour la même période (article R323-11 du Code de la sécurité sociale, version en vigueur depuis le 14 avril 2021).
Pour vous, la différence tient surtout à la trésorerie. Sans subrogation, vous attendez le paiement de la caisse, qui dépend de l’attestation de salaire envoyée par l’employeur. Avec subrogation, votre salaire tombe à la date habituelle. Cependant, la subrogation ne crée aucun droit supplémentaire. Elle modifie seulement le circuit de l’argent. Beaucoup de conventions collectives l’imposent, d’autres la laissent au choix de l’employeur.
Sur le bulletin, cherchez une ligne d’absence, une ligne d’indemnités journalières et une ligne de complément.
Si ces trois lignes ne se retrouvent pas, votre fiche de paie mérite une question écrite au service paie.
🧩 Cas d’école (situation fictive)
Prenons une salariée imaginaire payée 2 500 € bruts par mois, avec 3 ans d’ancienneté, sans convention plus favorable. Elle est arrêtée 10 jours. Son indemnité journalière atteint environ 41,10 € bruts, versée du 4e au 10e jour, soit près de 288 €. L’employeur complète jusqu’à 90 % pendant les jours 8 à 10, soit une centaine d’euros.
Elle perçoit ainsi environ 386 € bruts pour une période qui lui aurait rapporté près de 822 €. Qui porte le risque ? La salariée, pour la plus grande part de cet arrêt court, puisque les sept premiers jours restent peu ou pas couverts.
Ce cas montre que la loi protège les arrêts longs mieux que les arrêts courts. Les élus peuvent mesurer ce coût réel pour les salariés avant de négocier la carence conventionnelle.
Ce que votre convention collective peut changer
La convention collective peut supprimer la carence de l’employeur, réduire l’ancienneté exigée, maintenir le salaire à 100 % ou allonger la durée d’indemnisation. Elle ne peut pas faire moins bien que la loi. Un contrat de prévoyance collectif prend souvent le relais quand le complément légal s’arrête, pour les arrêts longs.
Ainsi, deux salariés au même salaire peuvent toucher des montants très différents pour le même arrêt. Tout dépend de leur branche et des accords de leur entreprise. Un salarié de la métallurgie, du commerce ou de la banque ne lit pas la même clause. Les communications internes résument parfois le dispositif en une phrase du type « maintien de salaire selon la convention ». Cette formule ne vous dit rien du délai, du taux ni de la durée. Demandez le texte exact, et la notice de prévoyance si l’entreprise en a souscrit une.
La recherche commence par l’intitulé de la convention collective figurant sur votre bulletin.
💡 Bon à savoir
Un arrêt maladie ne vous fait plus perdre tous vos congés payés. Depuis la loi du 22 avril 2024, les périodes d’arrêt pour maladie non professionnelle ouvrent droit à 2 jours ouvrables de congé par mois, dans la limite de 24 jours par période de référence (article L3141-5-1 du Code du travail, version en vigueur depuis le 24 avril 2024).
Ce que vous pouvez vérifier, et ce qui reste incertain
Vous pouvez vérifier trois montants avec des pièces simples : l’indemnité journalière sur votre relevé ameli ou votre bulletin, le complément de l’employeur au regard de votre ancienneté, et la carence appliquée au regard de votre convention. Sans ces documents, aucune estimation fiable n’est possible, et ce guide ne tranche pas votre cas.
Certaines situations restent délicates. Un arrêt qui suit de près un précédent arrêt, un contrat qui change de temps de travail, un salarié à employeurs multiples compliquent le calcul. Le plafond des indemnités évolue aussi avec le SMIC, et un montant correct en juin peut ne plus l’être en juillet. Pour les écarts persistants, un délégué syndical, un élu du CSE ou la caisse elle-même pourront examiner votre dossier. Un recours contre une décision de la caisse suit ses propres délais, détaillés dans notre article sur la CPAM et ses décisions.
Le montant versé par la caisse dépend d’un document transmis par l’employeur, détaillé dans notre guide de l’attestation de salaire. Si votre médecin envisage une reprise progressive, les règles d’indemnisation du mi-temps thérapeutique prennent le relais. Et si vous êtes en contrat court, lisez aussi notre article sur l’arrêt maladie en CDD, qui ne prolonge pas le terme du contrat.
Le levier démontrable tient dans la clause « maladie » de votre convention, confrontée ligne à ligne à votre bulletin de paie.
Questions fréquentes
Combien de jours de carence en arrêt maladie ?
La Sécurité sociale applique 3 jours de carence avant de verser les indemnités journalières. Le complément légal de l’employeur démarre au 8e jour. Votre convention collective peut réduire ou supprimer ces délais.
Quel est le montant maximal des indemnités journalières maladie ?
L’indemnité vaut 50 % du salaire journalier de base, plafonné à 1,4 fois le SMIC mensuel. Au 1er juillet 2026, le maximum est de 42,97 € bruts par jour selon ameli.fr.
L’employeur doit-il maintenir mon salaire pendant un arrêt maladie ?
Oui, à partir d’un an d’ancienneté et sous conditions : il complète les indemnités jusqu’à 90 % du brut pendant 30 jours, puis deux tiers pendant 30 jours, à partir du 8e jour. Ces durées augmentent avec l’ancienneté.
Pourquoi je ne reçois rien de la CPAM pendant mon arrêt ?
Si votre employeur pratique la subrogation, il perçoit les indemnités à votre place et vous verse votre salaire. Sinon, le retard vient souvent de l’attestation de salaire que l’employeur doit transmettre à la caisse.
